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Transporte Público, Bus Rapid Transit, Modelos de Tráfico, Logística e Investigación de Operaciones.
Juan Carlos Muñoz recibió el PhD en Ingeniería Civil y Ambiental y el MSc en Ingeniería Industrial e Investigación Operativa de la Univ of California at Berkeley en 2002.
Sus áreas de investigación son el transporte público, las redes de transporte, el tráfico y la logística. Lidera el Bus Rapid Transit Centre of Excellence (www.brt.cl) financiado por la Volvo Research and Educational Foundations. Es también Director del Centro de Desarrollo Urbano Sustentable (www.cedeus.cl).
Fue asesor el 2003 y 2004 del Ministro de Transportes y Telecomunicaciones para el plan Transantiago y en el 2008 fue miembro del comité de expertos creado por este Ministerio para mejorar el proyecto Transantiago. Fue miembro del Directorio del Metro Regional de Valparaíso desde el 2007 al 2010 y asesor del Presidente de Metro de Santiago en el mismo periodo. Desde marzo del 2014 a marzo 2017 fue Director de Metro y Asesor de la Dirección de Transporte Público Metropolitano.
También se dedica al diseño de turnos flexibles de trabajo para trabajadores de retail. En la actualidad, co-dirige la empresa Shift-UC dedicada a este último objetivo proveyendo soluciones cuantitativas a problemas de recursos humanos para el retail. Esta empresa asigna turnos de trabajo alrederor de 50.000 personas semanalmente en Chile, Colombia, Argentina, Perú, Uruguay y Brazil.
Es miembro del Editorial Advisory Board de la revista Trans Res B, de los Comités científico Internacionales de las Conferencias CASPT (Conference on Advanced Systems of Public Transport), ISTTT (International Symposium on Transporttion and Traffic Theory) y Thredbo (International Conference on Competition and Ownership in Land Passenger Transport). Ha participado en una innovación que recibió el premio nacional de innovación y otra el premio Sociedad CHilena de Ingeniería de Transporte
2017 Mejor paper comité transporte público de TRB
2016 Mejor paper comité tráfico autopistas de TRB
2015: Uno de los 4 mejores papers de Thredbo 15
2015 Premio Sociedad Chilena de Ingeniería de Transporte a la mejor intervención a un Sistema de transporte en Chile.
2002: Gordon F. Newell al estudiante de transporte destacado en UC Berkeley
1998: Beca Fulbright/ Presidente de la República
1995: Ismael Valdés Valdés al liderazgo (Instituto de Ingenieros de Chile)
1994 Premio Departamento Ing de Transporte en titulación ingenieros PUC